MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis H37Ra chromosome

Total Repeats: 109952

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_009525	TGG	2	6	43170	43175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659798
1003	NC_009525	TGC	2	6	43203	43208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659798
1004	NC_009525	GCCGCT	2	12	43216	43227	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	148659798
1005	NC_009525	GCT	2	6	43231	43236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659798
1006	NC_009525	CCAC	2	8	43239	43246	25 %	0 %	0 %	75 %	148659798
1007	NC_009525	CGAT	2	8	43248	43255	25 %	25 %	25 %	25 %	148659798
1008	NC_009525	CCG	3	9	43277	43285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1009	NC_009525	AGC	2	6	43296	43301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_009525	GCGTC	2	10	43302	43311	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1011	NC_009525	CAC	2	6	43503	43508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148659799
1012	NC_009525	GCCACC	2	12	43534	43545	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	148659799
1013	NC_009525	CGG	2	6	43553	43558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659799
1014	NC_009525	CG	3	6	43596	43601	0 %	0 %	50 %	50 %	148659799
1015	NC_009525	CAGCGC	2	12	43602	43613	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	148659799
1016	NC_009525	CGC	4	12	43668	43679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659799
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1018	NC_009525	GCC	2	6	43726	43731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1019	NC_009525	GCG	2	6	43796	43801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659800
1020	NC_009525	GGCC	2	8	43944	43951	0 %	0 %	50 %	50 %	148659800
1021	NC_009525	GGT	2	6	43977	43982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659800
1022	NC_009525	GAT	2	6	44082	44087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148659800
1023	NC_009525	TGA	2	6	44088	44093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148659800
1024	NC_009525	GT	3	6	44169	44174	0 %	50 %	50 %	0 %	148659800
1025	NC_009525	ACC	2	6	44215	44220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148659800
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1029	NC_009525	GGC	3	9	44434	44442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659800
1030	NC_009525	TGC	2	6	44528	44533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659800
1031	NC_009525	CCCG	2	8	44535	44542	0 %	0 %	25 %	75 %	148659800
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1039	NC_009525	CGT	2	6	44761	44766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_009525	GTG	2	6	44838	44843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_009525	GGC	2	6	44947	44952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659801
1042	NC_009525	CGA	2	6	44964	44969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659801
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1047	NC_009525	TGC	2	6	45248	45253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659801
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1051	NC_009525	CGA	2	6	45394	45399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659801
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1054	NC_009525	GC	3	6	45493	45498	0 %	0 %	50 %	50 %	148659801
1055	NC_009525	GGC	2	6	45550	45555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659801
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1057	NC_009525	CGA	2	6	45600	45605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659801
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1059	NC_009525	GAT	2	6	45747	45752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148659801
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1061	NC_009525	CGA	2	6	45783	45788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659801
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1063	NC_009525	CGA	2	6	45990	45995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659801
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1069	NC_009525	GGTAC	2	10	46220	46229	20 %	20 %	40 %	20 %	148659801
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1071	NC_009525	CGG	2	6	46317	46322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659801
1072	NC_009525	CAG	2	6	46397	46402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659801
1073	NC_009525	TCG	2	6	46415	46420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659801
1074	NC_009525	TCGAA	2	10	46452	46461	40 %	20 %	20 %	20 %	148659801
1075	NC_009525	CGA	2	6	46554	46559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659801
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1080	NC_009525	GAC	2	6	46858	46863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659801
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1083	NC_009525	GCTTAC	2	12	47014	47025	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	148659801
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1089	NC_009525	TCG	2	6	47393	47398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659801
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1095	NC_009525	ACC	2	6	47584	47589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148659801
1096	NC_009525	GCC	2	6	47623	47628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659801
1097	NC_009525	TCG	2	6	47633	47638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659801
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1102	NC_009525	CGA	2	6	47742	47747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659801
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1104	NC_009525	CGG	2	6	47837	47842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1106	NC_009525	CGG	2	6	47904	47909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_009525	TTGC	2	8	47964	47971	0 %	50 %	25 %	25 %	148659802
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1109	NC_009525	CG	3	6	48080	48085	0 %	0 %	50 %	50 %	148659802
1110	NC_009525	CCGC	2	8	48112	48119	0 %	0 %	25 %	75 %	148659802
1111	NC_009525	GCG	2	6	48124	48129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659802
1112	NC_009525	CCGC	2	8	48145	48152	0 %	0 %	25 %	75 %	148659802
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1114	NC_009525	GCC	2	6	48199	48204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659802
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1119	NC_009525	ACA	2	6	48555	48560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148659802
1120	NC_009525	TCATG	2	10	48562	48571	20 %	40 %	20 %	20 %	148659802
1121	NC_009525	CTAC	2	8	48577	48584	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1122	NC_009525	GCT	2	6	48694	48699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_009525	ATCGG	2	10	48709	48718	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1124	NC_009525	GAG	2	6	48737	48742	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148659803
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1126	NC_009525	CGG	3	9	48821	48829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659803
1127	NC_009525	GCAG	2	8	48877	48884	25 %	0 %	50 %	25 %	148659803
1128	NC_009525	GCG	2	6	48917	48922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659803
1129	NC_009525	CGT	2	6	48948	48953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659803
1130	NC_009525	TGG	2	6	49014	49019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659803
1131	NC_009525	TCG	2	6	49043	49048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659803
1132	NC_009525	GGC	2	6	49162	49167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659803
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1134	NC_009525	CGC	2	6	49254	49259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659803
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1172	NC_009525	CAGC	2	8	51246	51253	25 %	0 %	25 %	50 %	148659805
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1239	NC_009525	TAG	2	6	54064	54069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1241	NC_009525	CCG	2	6	54098	54103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1242	NC_009525	CAA	2	6	54112	54117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1245	NC_009525	CTG	2	6	54216	54221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659809
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1251	NC_009525	CCG	2	6	54409	54414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659809
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